Indépendamment des goûts culinaires de chacun, on préfèrera planter des plants mycorhizés avec la truffe de Bourgogne Tuber uncinatum dans les régions à hiver rigoureux, car cette truffe vient à maturité plus tôt que la truffe du Périgord Tuber melanosporum. Elle pourra être récoltée avant les fortes gelées tandis que la truffe du Périgord se plantera principalement dans l'Ouest et le Sud de la France.

La conduite d'un " verger " truffier est très différente de celle d'un verger fruitier classique : Il faut à la fois prendre soin de l'arbre et du champignon, et veiller au bon développement des racines.Deux points essentiels à retenir :
- Assurer à la plante hôte un bon enracinement avec une croissance régulière.
- Permettre au champignon de se maintenir en symbiose avec le système racinaire de la plante. On préfèrera pratiquer une culture raisonnée en aidant la nature seulement lorsque cela sera nécessaire.